파친코 2편은 재일교포 2~3세의 삶을 주로 다루고 있다. 영도에서 훈이와 결혼한 양진의 고단한 삶과 그들에게서 태어난 선자는 어린 시절 한수와 사랑을 나누고 그의 아들 노아를 낳게 되었다. 이미 일본에 일본인 여자와 딸이 있다는 사실을 모른채 한수와 사랑을 나눴던 선자는 한수에게 느꼈던 감정을 후회하고 평생 과부로 살지도 모른다는 두려움 속에 살게 된다. 그런 그녀를 거두어 아들에게 자신을 성을 나누어준 백이삭에 이끌려 일본에서의 삶을 시작한다. 선자는 한수의 아들 노아와 이삭의 아들 모자수를 일본에서 힘겹게 키운다. 조선인으로서 일본에서 가족을 부양한다는 것은 쉬운 일이 아니었다. 게다가 이삭이 일본경찰에 끌려가 모진 고문 끝에 사망하자 선자는 이를 악물고 두 아들을 위해 온갖 궃은 일을 마다하며 가족을 부양한다. 같은 어머니가 키웠지만, 아버지가 달라서일까. 노아와 모자수는 각자 다르게 성장하게 된다. 노아는 학구열이 강해 재수 끝에 와세다 대학에 입학해 대학생일 되고, 모자수는 거친 성격을 바탕으로 일찍 사회에 진출해 파친코 사업에 뛰어든다. 두 아들 모두 각자의 위치에서 사랑을 찾아 고군분투하기도 했는데, 노아는 와세다 대학에서 만난 아키코와 연애를 시작하고, 모자수는 재봉사인 유미를 만나 결혼을 한다.
도저히 과부의 신분으로 사립대학의 등록금을 충당할 수 없었던 선자는 한수에게 도움을 구하고, 자신의 핏줄을 아끼는 한수는 자신이 아버지라는 사실을 숨긴채 노아의 후원자가 된다. 그 사실을 모르는 노아는 한수에게 감사함을 느끼며, 여유로운 대학 생활을 할 수 있었다. 그러나 이는 오래가지 못하고 한수가 자신의 아버지라는 사실, 그리고 자신이 야쿠자의 아들이라는 사실에 분노하며, 어머니를 원망하고, 다니던 학교는 그만두고 행적을 감춘다. 노아는 조선인으로서의 정체성을 버리고, 반 부오노 라는 일본인으로 새로운 삶을 시작한다. 하지만 운명의 장난인지 노아의 진로는 파친코를 향하게 된다. 결국 다른 삶을 살아왔던 노아와 모자수 모두 파친코로 귀결되는 운명을 가지게 된 것이었다. 선자는 숨어 살던 노아를 찾아냈지만, 노아는 자살로 생을 마감하게 된다. 그리고 모자수의 아들이자 재일교포 3세인 솔로몬은 미국에서 유학하며 미국계 한국인 피비와 결혼하려 했지만 일본에서의 생활을 통해 결국 이별을 맞이하게 되고, 솔로몬 또한 아버지의 파친코를 이어받아 파친코 사업을 시작하면서 이야기는 마무리된다.
파친코는 일본 야쿠자 사업이라는 인식이 있다. 혼란의 시대에 일본에서 살아남기 위해 발버둥쳤던 조선인 가족이 결국 일본에서 일본인을 통해 돈을 버는 파친코를 하게 되는 시대의 운명을 잘 표현한 이야기였다. 일제강점기부터 현대에 이르기까지의 한국과 일본의 역사를 '파친코'와 '가족'의 삶을 통해 시대를 관통하는 책이었다.